La nueva consola WiiU soportará software de Wii, incluyendo juegos en formato físico de Wii, Consola Virtual Wii y WiiWare. Sin embargo Nintendo América ha confirmado que no se podrán jugar con el GamePad de WiiU; se podrán jugar con un mando WiiPlus o un mando clásico ya que serán compatibles con WiiU.
Esto es algo similar a la retro-compatibilidad de Wii con GameCube (los juegos de Nintendo GameCube son jugables en la mayoría de consolas Wii, sin embargo no funcionan con los mandos de Wii). También es preciso recordar que los juegos de GameCube no serán compatibles con WiiU.
